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测序质量分档台账 Skill
送样质量一账管:峰图质量分与有效读长登记后自动分 A/B/C 三档并给处理建议,C 档没标重送的单列出来,重送前该换引物还是该改方法一目了然。
📁 测序质量分档台账 Skill /
SKILL.md0.8 KB
scripts
seq_quality.py3.6 KB
data
seqqc.csv0.2 KB
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SKILL.md
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name: seq-quality-ledger
description: 送样质量一账管:峰图质量分与有效读长登记后自动分 A/B/C 三档并给处理建议,C 档没标重送的单列出来,重送前该换引物还是该改方法一目了然。
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# 测序质量分档台账 Skill
## 触发条件
批量送样后要挑哪些重送、团队里多人送样质量参差、想统一管理测序台账的时候使用。
## 执行步骤
1. 每次送样用 --add 登记样品、平台、质量分与读长。
2. 质量分低于 20 会在待重送清单里被点名。
3. 跑 --report 看分档与处理建议。
4. 送样批次与平台要记清,跨平台数据不混着分析。
## 依赖
仅 Python 标准库(argparse/csv/datetime/pathlib)。
## 输出
seq_quality.md:质量分档表(分档/建议/重送标记)、待重送清单与三条判读提醒。
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