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微生物生长曲线拟合 Skill
微生物生长曲线一键拟合:OD 随时间数据走 logistic 模型,输出比生长速率、代时、延滞期与半最大点,参数口径写清可与实测斜率互校。
📁 微生物生长曲线拟合 Skill /
SKILL.md0.9 KB
scripts
growth_fit.py4.3 KB
data
growth.csv0.1 KB
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SKILL.md
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name: growth-curve-fit
description: 微生物生长曲线一键拟合:OD 随时间数据走 logistic 模型,输出比生长速率、代时、延滞期与半最大点,参数口径写清可与实测斜率互校。
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# 微生物生长曲线拟合 Skill
## 触发条件
做菌种生长特性、比较不同培养条件下的繁殖速度、算代时评估扩增效率的时候使用。
## 执行步骤
1. 把时间与 OD 两列整理成 CSV(时间单位自定,--timescale 标注)。
2. 至少 4 个点,且要覆盖延滞期、对数期与稳定期。
3. 跑脚本得比生长速率与代时。
4. 用实测对数期斜率复核,数据点少时拟合值仅供参考。
## 依赖
仅 Python 标准库(argparse/csv/math/pathlib)。
## 输出
growth_fit.md:K、比生长速率、代时、延滞期与半最大点表,附口径说明与三条提醒。
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