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限制酶切位点查找 Skill
连接方案确定前先把酶切开:在序列里找常用限制酶的识别位点,标出切点位置、片段长度与黏性末端类型,环状线性两种情况都算得清。
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SKILL.md0.8 KB
scripts
restrict_find.py3.5 KB
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SKILL.md
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name: restriction-site-finder
description: 连接方案确定前先把酶切开:在序列里找常用限制酶的识别位点,标出切点位置、片段长度与黏性末端类型,环状线性两种情况都算得清。
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# 限制酶切位点查找 Skill
## 触发条件
设计克隆方案、确认载体上有几个切点、算酶切后片段多长的时候使用。
## 执行步骤
1. 序列跟 --seq,酶名用 --enzymes 逗号分隔(不给就全查)。
2. 用 --list-enzymes 看内置的十种常用酶与末端类型。
3. 按切点位置与片段长度核对设计图。
4. 实际酶切记得在识别位点两侧留 flanking 序列。
## 依赖
仅 Python 标准库(argparse/pathlib)。
## 输出
digest_map.md:逐酶的切点位置、片段长度与末端类型,附三条酶切注意事项。
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